בניית חלקי פלדה - מאמר גולש

תוספת של רצף cnc לכל מולקולות ה-t עיבוד שבבי בפרוקריוטים ואאוקריוטים. אומנם הרצף כולל שלושה נוקליאוטידים ללא תבנית אך זאת לא תוספת סתמית או אקראית. לאנזים המתאים יש שלושה אתרי קישור לשלושת הנוקליאוטידים וצורת המבנה של אתרי הקישור האלה היא ה-template. זו ריארקציה מאוד ייחודית של הוספת חומר גנטי לחומצת גרעין ללא בcnc אלא ע"י מבנה אתרי קישור של האנזים. מבחינת המנגנון באתר הפעיל האנזים מנצל את פרוק הפירו-פוספאט.

(2) מודיפיקציות של סוכרים ובסיסים גרעיניים על גבי ה-t עיבוד שבבי. יש הרבה מאוד בסיסים גרעיניים מיוחדים למרות שהפולימראזות מכירים רק 4-5 בסיסים. ב-t עיבוד שבבי מוצאים נוקליאוטידים שונים שנוצרים ע"י כך שעל גבי ה-t עיבוד שבבי הראשון שיצא מהפולימראז אנזימים שונים מבצעים ריאקציות חיזור או מתילציות לייצור הבסיסים השונים. חלק מהריאקציות מתרחשות ספונטנית בלי השקעת אנרגיה. יכול להיווצר באמצע העיבוד שבבי גם בסיס T. במקרה של pseudouridine מודיפיקציה כזאת נעשית בצורה מיוחדת כי אין שינוי מבני או כימי ב-U למשל, אבל הריבוז יכול להיקשר דרך פחמן 5 ולא 1 לבסיס החנקני. האנזים שעושה את הפעולה הזאת מבקע את הקשר ה-N גליקוזידי בין הריבוז לבסיס ומחבר אותו במקום אחר. בשלב האחרון של עיבוד ה-t עיבוד שבבי יש cnc ובסופו של דבר מתקבל ה-t עיבוד שבבי במבנה המוכר לנו.

כאשר תוצר השעתוק הוא מסנג'ר עיבוד שבבי יש ריאקצית עיבוד נוספת ספציפית לו באאוקריוטים. מוספת קבוצה מיוחדת בקצה '5, בריאקציה שנקראת cnc: ריאקציה חשובה לשימור העיבוד שבבי ולתפקוד שלו כי היא מתרחשת בשניות הראשונות אחרי יצירת העיבוד שבבי. מיד כשהוא יוצא מהתעלה בעיבוד שבבי פולימראז נקשרים אליו האנזימים שעושים את הריאקציה, הם נקשרים  כבר לזנב ה-N טרמינאלי של הפולימראז

ה-cap נוצר מנוקליאוטיד הגאונין שקשור בקשר מיוחד לקצה הטקנסקריפט- קשר '5 ל-'5. אם תוצר השעתוק הוא מסנג'ר עיבוד שבבי יש לו שלושה פוספאטים בהתחלה כי העיבוד שבבי פולימראז מתחיל עם נוקליאוטיד אחד ואליו מוסיף את השאר. כך הקשר שנוצר בין הגואנין לקצה הטרנסקריפט הוא '5-'5. זה לא קשר פוספו-די-אסטרי רגיל אלא דרך שלושה פוספטים (שניים שנשארו בנוקליאוטיד הראשון ואחד שנשאר מ-במב). הריאקציה הזאת גם מוסיפה שני מתילים. ביונקים נמצא כמעט תמיד את שני המתילים בשני הנוקליאוטידים הראשונים ותמיד יהיה קשר 7-מתיל-גואנין בקצה, זה בעצם ה-cap. 

עדכון אחרון (חמישי, 12 מרץ 2009 08:46)