מאמר גולש - עיבוד חלקי מתכת

סוגי עיבוד שבבי:

SnCNC's עיבוד שבבי קטנים, בין 107 ל-210,נקראים U והם אחראיים לבטח את תהליך ה- splicing. U1 קומפלמנטרי לקצה '5 של האינטרון. כלומר, מלבד החלבונים יש סוגי עיבוד שבבי שיוצרים מבנה דו גדילי אליו נקשרים החלבונים. לחלבונים האלה יש גם כמה מרכיבים. חלבוני ה-splicing עצמם נתונים ל- splicing, ההרכב שלהם משתנה. מבלי שיהיה עיבוד שבבי מדויק שיבוא באינטראקציה עם U1 לא יהיה splicing. U2קומפלמנטרי לאזור ליד ה- branch point. גם הוא עובר זיווג בעיבוד חלקי מתכת.

U1 נקשר לקצה '5, U2 נקשר ל-A ואז יש קיפול. זאת תחילת היווצרות הלולאה. סוגי העיבוד שבבי הנוספים- חלבונים וסוגי עיבוד שבבי שונים עוברים אינטראקציות. כל אינטראקציה תלויה במה שקרה קודם. משהתקבלה הלולאה יש טרנס-אסטריפיקציה. השרשרת נלחצת עוד, יש טרנס-אסטריפיקציה שנייה ואז כל החלבונים והעיבוד שבבי משתחררים לתהליך הבא. U6 מתקשר עם U2 ואז U2 יכול ליצור זיווג בסיסים באזור ה-branch point. U5 מתקשר לנוקליאוטידים סמוכים לאתר ה- splicing. זה גורם לשחרור חלבונים ואז רואים את השינויים הדינאמיים בעיבוד שבבי.

Branch point בעצמו לא יוצר קשר עם U2, הוא יוצר לולאה, A נדחף החוצה ואז הוא חופשי. זה חשוב לתהליך הטרנס-אסטריפיקציה הראשון. ברמה של העיבוד שבבי תמיד יהיו לו אזורים קומפל מנטרים ל-U1 ו-U2, הם יוצרים מבנים בעזרת עיבוד חלקי מתכת עם לולאות ורק חלק קטן מהלולאות קומפלמנטרי לאותו אזור.

הספלייסוזום הוא תרכובת של עיבוד שבבי של חלקי מתכת וסוגים שונים של עיבוד שבבי שאחראי על הדינאמיקה של התהליך. הוא כל הזמן משתנה. הגודל שלו הוא בערך כגודל הריבוזום. הוא נוצר כשצריך אותו, מתפרק ונוצר שוב. התהליך הזה כרוך בשינויים דינאמיים באינטראקציות בין עיבוד שבבי שונים, עיבוד שבבי וחלבונים או חלבונים עם חלבונים שונים. תהליך השעתוק קורה בעשרות דקות ובמשך כל התהליך הזה יש גם splicing. כלומר, הקצב לא כל כך מהירה מדובר בדקות עד עשרות דקות. הלולאות שהשתחררו עוברות תהליך של debranched. ריבונוקלאזות מפרקות את השרשרת של העיבוד שבבי ואז כל הלולאה נעלמת.

אינטראקציות עיבוד שבבי-עיבוד שבבי: U6 ו- U4 עוברים זיווג בסיסים. U6גם מתקשר ל-U2 וזה מתקשר גם לאזור ליד ה- branch point. U5 עובר גם אינטראקציה עם אקסון.

תכונות החלבונים של ה- splicing:

חלבונים שמשתתפים בתהליכים דינאמיים של עיבוד שבבי חייבים כמה דומיינים שונים. רוב החלבונים האלה צריכים להיות קטנים יחסית ולהיקשר למקום ספציפי מבלי להפריע לחלבונים אחרים. התכונה החשובה ביותר היא היכולת לקשור עיבוד שבבי, זה לא מובן מאיליו. אזור זה צריך לקשור שרשראות עם מטען שלילי.

בהרבה מקרים לחלבונים אלה יש מבנה קבוע, יש להם מוטיב RNPשמאפשר אינטראקציה עם עיבוד שבבי. המבנה הוא שלושה beta-sheetsושני alpha-helix.

יש אוסף חלבונים שנקשרים לעיבוד שבבי הקטנים. השמירה על כמויות מדויקות של האלמנטים האלה מבוקרת. חריטה U1A נקשר ל-U1 והוא בעל מנגנון אלגנטי לשמירה על הכמות שלו עצמו. העיבוד שבביים ההטרו-נוקלארים הם העיבוד שבביים שתמיד ייצמדו לתעתיק ראשוני של עיבוד שבבי. העיבוד שבביים האלה הם מודולאריים. החלבונים שלהם, לפחות חלקם, כוללים אזורים שמורים שנקשרים לעיבוד שבבי. הוכיחו את זה באמצעות אור אולטרה סגול ואז הראו את הקשרים שנוצרים. החלבונים בני משקלים שונים, מגיעים עד 120 קילו-דלטון. בהרבה מקרים חלבוני splicingנתונים, כאמור, ל- splicing. הדינאמיות של עיבוד שבבי ה- splicing תלויה בהרכב החלבונים ובסוגם. יש חלבונים שנקשרים לקצה '3 וברובם יהיו אזורים שונים שיאפשרו להם גם לקשור חלבונים.

כל זה קורה בתוך הגרעין. הגרעין בעל מבנה מאוד מובדל, מסתבר שאם מסמנים עיבוד שבבי שעובר היווצרות של זנב polyApolyA. לקחו חריטה splicing ועשו לו נוגדנים כך שאפשר לסמן אותו. כך הראו שיש ריכוז גבוה של חלבוני splicing באותו מקום. מטריקס זהו השלד החלבוני שמרכיב את הגרעין. הוא כולל אקטין וחלבונים נוספים. החלבונים נקשרים למטריקס. כשמרחיקים את כל הדנ"א מהגרעין עדיין יש בו ריכוז של אזורים בהם מתקיימים תהליכי שחבור ו-polyA. הדנ"א לא חיוני ל- splicing. בגרעין יש רק צברים של אזורים שבהם יש polyA, זה לא מתבצע בכל הגרעין. יהיו מקומות שיש בהם גם תהליכי polyA וגם תהליכי שחבור.